| 1. Jornada | 02.08.2008 | Viktoria Plzeň | - | Viktoria Žižkov | 3:2 | ||||
| 2. Jornada | 10.08.2008 | Sigma Olomouc | - | Viktoria Plzeň | 2:1 | ||||
| 3. Jornada | 16.08.2008 | Viktoria Plzeň | - | Slavia Praga | 1:1 | ||||
| 4. Jornada | 23.08.2008 | Slovan Liberec | - | Viktoria Plzeň | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 30.08.2008 | Viktoria Plzeň | - | FK Teplice | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 14.09.2008 | 1. FK Příbram | - | Viktoria Plzeň | 2:2 | ||||
| 7. Jornada | 20.09.2008 | Viktoria Plzeň | - | Dynamo České Budějovice | 1:1 |  |
|||
| 8. Jornada | 27.09.2008 | Viktoria Plzeň | - | Baník Ostrava | 1:3 | ||||
| 9. Jornada | 04.10.2008 | Tescoma Zlín | - | Viktoria Plzeň | 2:0 | |
|||
| 10. Jornada | 19.10.2008 | Viktoria Plzeň | - | Sparta Praga | 1:1 | ||||
| 11. Jornada | 26.10.2008 | Bohemians Praha | - | Viktoria Plzeň | 0:2 | ||||
| 12. Jornada | 01.11.2008 | Viktoria Plzeň | - | FK Baumit Jablonec | 1:1 |  |
|||
| 13. Jornada | 09.11.2008 | 1. FC Brno | - | Viktoria Plzeň | 1:2 |  |
|||
| 16. Jornada | 29.11.2008 | Viktoria Plzeň | - | Sigma Olomouc | 4:0 | |
República Checa