| 1. Jornada | 02.08.2024 | FC Zlínsko | - | FC Zlín B | 3:0 |  |
|||
| 2. Jornada | 11.08.2024 | FC Zlín B | - | SK Uničov | 3:1 | ||||
| 3. Jornada | 17.08.2024 | FC Strání | - | FC Zlín B | 1:2 | ||||
| 4. Jornada | 25.08.2024 | FC Zlín B | - | Hanácká Slávia Kroměříž | 0:2 | ||||
| 5. Jornada | 31.08.2024 | TJ Unie Hlubina | - | FC Zlín B | 0:5 |  |
|
||
| 6. Jornada | 07.09.2024 | FC Zlín B | - | FK Třinec | 3:1 | |
|||
| 17. Jornada | 11.09.2024 | FC Zlín B | - | ČSK Uherský Brod | 0:1 | ||||
| 8. Jornada | 21.09.2024 | FC Zlín B | - | 1. FC Slovácko B | 2:0 | ||||
| 9. Jornada | 29.09.2024 | FK Frýdek-Místek | - | FC Zlín B | 2:1 | |
|||
| 10. Jornada | 05.10.2024 | FC Zlín B | - | FC Slovan Rosice | 3:1 | ||||
| 7. Jornada | 09.10.2024 | FK Hodonín | - | FC Zlín B | 4:2 | ||||
| 11. Jornada | 12.10.2024 | TJ Start Brno | - | FC Zlín B | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 20.10.2024 | FC Zlín B | - | FC Hlučín | 2:4 | ||||
| 13. Jornada | 27.10.2024 | MFK Karviná B | - | FC Zlín B | 1:2 | ||||
| 14. Jornada | 02.11.2024 | 1. SC Znojmo | - | FC Zlín B | 3:1 | ||||
| 15. Jornada | 09.11.2024 | FC Zlín B | - | FC Zbrojovka Brno B | 2:1 | ||||
| 16. Jornada | 16.11.2024 | FK Blansko | - | FC Zlín B | 2:4 |
República Checa