| 3. Jornada | 14.08.2016 | Terek Grozny | - | Lokomotiv Moskva | 1:1 | ||||
| 4. Jornada | 21.08.2016 | Lokomotiv Moskva | - | Krylia Sovetov | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 15.10.2016 | FK Amkar Perm | - | Lokomotiv Moskva | 0:0 | ||||
| 11. Jornada | 23.10.2016 | Lokomotiv Moskva | - | CSKA Moscú | 1:0 | ||||
| 12. Jornada | 31.10.2016 | Rubin Kazan | - | Lokomotiv Moskva | 2:0 | ||||
| 13. Jornada | 05.11.2016 | Lokomotiv Moskva | - | Anzhi Makhachkala | 4:0 | ||||
| 14. Jornada | 19.11.2016 | FK Orenburg | - | Lokomotiv Moskva | 1:1 | ||||
| 15. Jornada | 26.11.2016 | Lokomotiv Moskva | - | FK Ural | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 01.12.2016 | FK Tom Tomsk | - | Lokomotiv Moskva | 1:6 | ||||
| 17. Jornada | 04.12.2016 | Lokomotiv Moskva | - | Terek Grozny | 2:0 | ||||
| 18. Jornada | 05.03.2017 | Krylia Sovetov | - | Lokomotiv Moskva | 0:3 | ||||
| 19. Jornada | 13.03.2017 | Lokomotiv Moskva | - | FK Krasnodar | 1:2 | ||||
| 21. Jornada | 01.04.2017 | FK Ufa | - | Lokomotiv Moskva | 0:1 |  |
|||
| 23. Jornada | 16.04.2017 | Arsenal Tula | - | Lokomotiv Moskva | 0:3 | ||||
| 24. Jornada | 22.04.2017 | Lokomotiv Moskva | - | FK Amkar Perm | 3:3 | ||||
| 25. Jornada | 26.04.2017 | CSKA Moscú | - | Lokomotiv Moskva | 4:0 |
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