| 1. Jornada | 27.07.2008 | Fortuna Düsseldorf | - | SC Paderborn 07 | 1:4 |  |
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| 2. Jornada | 02.08.2008 | Stuttgarter Kickers | - | Fortuna Düsseldorf | 0:2 | ||||
| 20. Jornada | 20.12.2008 | SC Paderborn 07 | - | Fortuna Düsseldorf | 0:0 | ||||
| 21. Jornada | 05.02.2009 | Fortuna Düsseldorf | - | Stuttgarter Kickers | 2:0 | ||||
| 22. Jornada | 14.02.2009 | Fortuna Düsseldorf | - | Wacker Burghausen | 3:1 |  |
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| 23. Jornada | 22.02.2009 | SpVgg Unterhaching | - | Fortuna Düsseldorf | 2:1 | ||||
| 24. Jornada | 28.02.2009 | Fortuna Düsseldorf | - | SV Sandhausen | 3:2 | |
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| 25. Jornada | 07.03.2009 | Jahn Regensburg | - | Fortuna Düsseldorf | 1:2 | ||||
| 26. Jornada | 14.03.2009 | Fortuna Düsseldorf | - | Erzgebirge Aue | 0:0 | |
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| 27. Jornada | 21.03.2009 | Rot-Weiß Erfurt | - | Fortuna Düsseldorf | 2:0 | ||||
| 28. Jornada | 28.03.2009 | Fortuna Düsseldorf | - | Kickers Emden | 1:1 | ||||
| 35. Jornada | 10.05.2009 | Eintracht Braunschweig | - | Fortuna Düsseldorf | 5:5 | ||||
| 37. Jornada | 16.05.2009 | VfR Aalen | - | Fortuna Düsseldorf | 1:2 | |
Alemania