| 4. Jornada | 08.03.2009 | Sporting Cristal | - | Cienciano | 0:2 | ||||
| 5. Jornada | 15.03.2009 | Cienciano | - | César Vallejo | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 22.03.2009 | Sport Huancayo | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| 7. Jornada | 05.04.2009 | Cienciano | - | Sport Áncash | 0:0 | ||||
| 8. Jornada | 12.04.2009 | Alianza Lima | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| 9. Jornada | 19.04.2009 | Cienciano | - | Coronel Bolognesi | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 26.04.2009 | Juan Aurich | - | Cienciano | 1:1 | ||||
| 11. Jornada | 03.05.2009 | Cienciano | - | Alianza Atlético | 3:0 | ||||
| 12. Jornada | 10.05.2009 | CN Iquitos | - | Cienciano | 1:3 |  |
|||
| 14. Jornada | 17.05.2009 | Cienciano | - | Inti Gas | 3:0 | ||||
| 16. Jornada | 31.05.2009 | FBC Melgar | - | Cienciano | 2:2 | ||||
| 17. Jornada | 14.06.2009 | Cienciano | - | José Gálvez | 1:0 | ||||
| 18. Jornada | 21.06.2009 | Universitario de Deportes | - | Cienciano | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 28.06.2009 | Cienciano | - | Sporting Cristal | 5:5 |  |
|||
| 13. Jornada | 01.07.2009 | Universidad San Martín | - | Cienciano | 2:1 |
Perú