| Segunda etapa | 20.09.2012 | Cerro Porteño | - | Mineros de Guayana | 4:0 |  |
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| Octavos de final | 28.09.2012 | Colón de Santa Fe | - | Cerro Porteño | 1:2 | |
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| Octavos de final | 24.10.2012 | Cerro Porteño | - | Colón de Santa Fe | 2:1 | |
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| Cuartos de final | 01.11.2012 | Cerro Porteño | - | Tigre | 1:0 | |
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| Cuartos de final | 09.11.2012 | Tigre | - | Cerro Porteño | 4:2 |
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