| 5. Jornada | 27.09.1998 | SC Salgueiros | - | Boavista | 0:0 | ||||
| 6. Jornada | 05.10.1998 | Boavista | - | Sporting Braga | 1:0 | ||||
| 7. Jornada | 18.10.1998 | Oporto | - | Boavista | 0:2 |  |
|||
| 8. Jornada | 25.10.1998 | Boavista | - | Benfica | 2:1 | ||||
| 10. Jornada | 06.11.1998 | Boavista | - | GD Chaves | 4:1 | ||||
| 11. Jornada | 13.11.1998 | Académica de Coimbra | - | Boavista | 2:3 | |
|||
| 16. Jornada | 18.12.1998 | Boavista | - | SC Farense | 3:0 | ||||
| 19. Jornada | 23.01.1999 | Boavista | - | FC Alverca | 3:0 | ||||
| 20. Jornada | 30.01.1999 | Boavista | - | Campomaiorense | 2:1 | ||||
| 21. Jornada | 07.02.1999 | União Leiria | - | Boavista | 0:0 | ||||
| 22. Jornada | 12.02.1999 | Boavista | - | SC Salgueiros | 2:1 | |
 |
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| 23. Jornada | 20.02.1999 | Sporting Braga | - | Boavista | 1:2 | |
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| 24. Jornada | 28.02.1999 | Boavista | - | Oporto | 0:0 | ||||
| 28. Jornada | 16.04.1999 | Boavista | - | Académica de Coimbra | 3:1 | ||||
| 31. Jornada | 09.05.1999 | Rio Ave FC | - | Boavista | 0:2 | ||||
| 33. Jornada | 22.05.1999 | SC Farense | - | Boavista | 2:2 |
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