| 1. Jornada | 13.07.2009 | Millonarios | - | Atlético Junior | 3:1 |  |
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| 8. Jornada | 30.08.2009 | Atlético Junior | - | Boyacá Chicó | 5:2 | |
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| 9. Jornada | 13.09.2009 | Atlético Junior | - | Real Cartagena | 3:1 | |
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| 11. Jornada | 27.09.2009 | Atlético Junior | - | Envigado FC | 4:1 | |
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| 12. Jornada | 05.10.2009 | Independiente Medellín | - | Atlético Junior | 1:0 | ||||
| 13. Jornada | 18.10.2009 | Atlético Junior | - | Deportivo Pereira | 1:1 | ||||
| 15. Jornada | 25.10.2009 | Atlético Junior | - | América de Cali | 3:0 | ||||
| 16. Jornada | 01.11.2009 | Atlético Huila | - | Atlético Junior | 2:1 | ||||
| 18. Jornada | 15.11.2009 | Atlético Junior | - | Deportes Tolima | 2:1 | |
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