| 3. Jornada | 15.08.1998 | SV Babelsberg 03 | - | 1. FC Union Berlin | 0:4 | ||||
| 4. Jornada | 19.08.1998 | FC Carl Zeiss Jena | - | SV Babelsberg 03 | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 22.08.1998 | SV Babelsberg 03 | - | FSV Zwickau | 0:0 | ||||
| 6. Jornada | 29.08.1998 | SD Croatia Berlin | - | SV Babelsberg 03 | 0:1 | ||||
| 7. Jornada | 12.09.1998 | FC Berlin | - | SV Babelsberg 03 | 3:1 |  |
|||
| 8. Jornada | 18.09.1998 | SV Babelsberg 03 | - | VfB Leipzig | 3:3 | |
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| 9. Jornada | 27.09.1998 | VFC Plauen | - | SV Babelsberg 03 | 2:0 | ||||
| 10. Jornada | 10.10.1998 | SV Babelsberg 03 | - | Dresdner SC | 3:0 | ||||
| 11. Jornada | 18.10.1998 | Lok Altmark Stendal | - | SV Babelsberg 03 | 1:0 | ||||
| 12. Jornada | 24.10.1998 | SV Babelsberg 03 | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:4 | ||||
| 13. Jornada | 07.11.1998 | Erzgebirge Aue | - | SV Babelsberg 03 | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 14.11.1998 | SV Babelsberg 03 | - | Spandauer SV | 1:1 | ||||
| 15. Jornada | 21.11.1998 | Stahl Eisenhüttenstadt | - | SV Babelsberg 03 | 2:3 | ||||
| 16. Jornada | 05.12.1998 | SV Babelsberg 03 | - | Sachsen Leipzig | 1:2 |  |
|||
| 18. Jornada | 23.01.1999 | Chemnitzer FC | - | SV Babelsberg 03 | 4:0 | ||||
| 20. Jornada | 06.02.1999 | 1. FC Union Berlin | - | SV Babelsberg 03 | 3:0 |
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