| 19. Jornada | 16.03.2009 | FC Lugano | - | FC Wil 1900 | 0:2 | ||||
| 21. Jornada | 02.04.2009 | FC Stade Nyonnais | - | FC Wil 1900 | 1:0 | ||||
| 22. Jornada | 09.04.2009 | Servette FC | - | FC Wil 1900 | 1:1 | ||||
| 23. Jornada | 18.04.2009 | FC Wil 1900 | - | FC La Chaux-de-Fonds | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 22.04.2009 | FC Wil 1900 | - | FC Winterthur | 1:1 | ||||
| 25. Jornada | 26.04.2009 | FC Concordia Basel | - | FC Wil 1900 | 3:4 | ||||
| 26. Jornada | 03.05.2009 | FC Wil 1900 | - | FC St. Gallen | 1:1 | ||||
| 27. Jornada | 09.05.2009 | Yverdon Sport FC | - | FC Wil 1900 | 1:1 | ||||
| 28. Jornada | 16.05.2009 | FC Wil 1900 | - | FC Thun | 2:0 | ||||
| 29. Jornada | 23.05.2009 | FC Wil 1900 | - | FC Biel/Bienne | 3:0 | ||||
| 30. Jornada | 30.05.2009 | FC Locarno | - | FC Wil 1900 | 0:1 |
Francia