| 1. Jornada | 02.08.2003 | KFC Uerdingen 05 | - | Wuppertaler SV | 0:3 | ||||
| 2. Jornada | 09.08.2003 | Wuppertaler SV | - | Eintracht Braunschweig | 1:1 | ||||
| 3. Jornada | 16.08.2003 | SG Wattenscheid 09 | - | Wuppertaler SV | 0:2 |  |
|||
| 4. Jornada | 23.08.2003 | Wuppertaler SV | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
| 6. Jornada | 06.09.2003 | Wuppertaler SV | - | Preußen Münster | 2:1 | |
|||
| 5. Jornada | 10.09.2003 | Dynamo Dresden | - | Wuppertaler SV | 3:0 | ||||
| 9. Jornada | 26.09.2003 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiss Essen | 2:0 | ||||
| 10. Jornada | 05.10.2003 | Chemnitzer FC | - | Wuppertaler SV | 1:2 | |
|||
| 11. Jornada | 11.10.2003 | Wuppertaler SV | - | SC Paderborn 07 | 0:3 | ||||
| 12. Jornada | 18.10.2003 | Schalke II | - | Wuppertaler SV | 0:2 | ||||
| 13. Jornada | 25.10.2003 | Wuppertaler SV | - | Borussia Dortmund II | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 02.11.2003 | Sachsen Leipzig | - | Wuppertaler SV | 4:0 | ||||
| 15. Jornada | 08.11.2003 | Wuppertaler SV | - | Colonia | 3:0 | |
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| 17. Jornada | 22.11.2003 | Wuppertaler SV | - | VfR Neumünster | 1:1 | |
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| 19. Jornada | 07.12.2003 | Eintracht Braunschweig | - | Wuppertaler SV | 0:1 | |
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