| 1. Jornada | 02.07.2016 | Alianza Petrolera | - | Atlético Nacional | 3:3 | ||||
| 5. Jornada | 24.07.2016 | Fortaleza FC | - | Atlético Nacional | 0:1 | ||||
| 6. Jornada | 01.08.2016 | Deportivo Cali | - | Atlético Nacional | 1:0 |  |
|||
| 8. Jornada | 15.08.2016 | Boyacá Chicó | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 16.10.2016 | Atlético Nacional | - | Atlético Huila | 4:0 | ||||
| 18. Jornada | 30.10.2016 | Atlético Nacional | - | Patriotas FC | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 07.11.2016 | Santa Fe | - | Atlético Nacional | 0:0 | ||||
| 20. Jornada | 20.11.2016 | Atlético Nacional | - | Deportivo Pasto | 3:1 |
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