| Primera etapa | 10.11.1999 | Talavera CF | - | CP Mérida | 1:0 | ||||
| Primera etapa | 01.12.1999 | CP Mérida | - | Talavera CF | 3:0 | ||||
| Segunda etapa | 15.12.1999 | CP Mérida | - | Betis | 1:0 | ||||
| Segunda etapa | 12.01.2000 | Betis | - | CP Mérida | 0:1 | ||||
| Octavos de final | 19.01.2000 | CP Mérida | - | Real Oviedo | 1:0 | ||||
| Octavos de final | 02.02.2000 | Real Oviedo | - | CP Mérida | 0:0 | ||||
| Cuartos de final | 09.02.2000 | Real Madrid | - | CP Mérida | 1:0 |
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