| 2. Jornada | 26.03.2006 | FK Rostov | - | FK Moskva | 4:0 |  |
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| 4. Jornada | 08.04.2006 | FK Rostov | - | Torpedo Moskva | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 17.04.2006 | Dinamo Moskva | - | FK Rostov | 0:1 |  |
|||
| 6. Jornada | 23.04.2006 | FK Rostov | - | Shinnik Yaroslavl | 0:0 | ||||
| 7. Jornada | 30.04.2006 | FK Tom Tomsk | - | FK Rostov | 3:1 | ||||
| 9. Jornada | 13.05.2006 | FK Amkar Perm | - | FK Rostov | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 17.05.2006 | Zenit | - | FK Rostov | 1:1 | ||||
| 10. Jornada | 10.07.2006 | CSKA Moscú | - | FK Rostov | 1:2 | ||||
| 13. Jornada | 31.07.2006 | FK Rostov | - | Spartak Nalchik | 2:1 | ||||
| 14. Jornada | 05.08.2006 | Spartak Moskva | - | FK Rostov | 5:2 | ||||
| 15. Jornada | 13.08.2006 | FK Rostov | - | Lokomotiv Moskva | 1:2 | ||||
| 16. Jornada | 20.08.2006 | FK Rostov | - | Rubin Kazan | 2:1 | ||||
| 17. Jornada | 27.08.2006 | FK Moskva | - | FK Rostov | 4:0 | ||||
| 19. Jornada | 16.09.2006 | Torpedo Moskva | - | FK Rostov | 0:2 | |
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| 23. Jornada | 21.10.2006 | FK Saturn | - | FK Rostov | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 08.11.2006 | FK Rostov | - | Luch-Energiya Vladivostok | 1:0 |
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