| 3. Jornada | 20.08.2006 | FC Carl Zeiss Jena II | - | VFC Plauen | 1:1 | ||||
| 4. Jornada | 26.08.2006 | Chemnitzer FC | - | FC Carl Zeiss Jena II | 2:1 | ||||
| 5. Jornada | 09.09.2006 | FSV Zwickau | - | FC Carl Zeiss Jena II | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 21.10.2006 | FC Carl Zeiss Jena II | - | SV Dessau 05 | 1:0 | ||||
| 11. Jornada | 04.11.2006 | FC Carl Zeiss Jena II | - | Germania Halberstadt | 3:0 |  |
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| 13. Jornada | 18.11.2006 | Rot-Weiß Erfurt II | - | FC Carl Zeiss Jena II | 1:3 |
Alemania