| 8. Jornada | 02.11.2008 | OFI Heraklion | - | Skoda Xanthi | 0:2 |  |
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| 15. Jornada | 20.12.2008 | Iraklis Saloniki | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 17. Jornada | 10.01.2009 | Olympiacos | - | Skoda Xanthi | 2:1 | |
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| 25. Jornada | 08.03.2009 | Skoda Xanthi | - | Panthrakikos | 1:0 | ||||
| 29. Jornada | 12.04.2009 | Skoda Xanthi | - | PAOK Saloniki | 1:2 | |
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| 30. Jornada | 26.04.2009 | Skoda Xanthi | - | Iraklis Saloniki | 4:1 |  |
Grecia