| 17. Jornada | 22.02.2009 | FK Mladá Boleslav | - | FK Baumit Jablonec | 1:2 | ||||
| 18. Jornada | 01.03.2009 | FK Baumit Jablonec | - | Sigma Olomouc | 1:0 | ||||
| 19. Jornada | 08.03.2009 | SK Kladno | - | FK Baumit Jablonec | 1:2 | ||||
| 20. Jornada | 15.03.2009 | FK Baumit Jablonec | - | Slavia Praga | 1:2 |  |
|||
| 21. Jornada | 22.03.2009 | Viktoria Žižkov | - | FK Baumit Jablonec | 0:1 | ||||
| 22. Jornada | 05.04.2009 | FK Baumit Jablonec | - | Dynamo České Budějovice | 2:0 | ||||
| 23. Jornada | 12.04.2009 | 1. FC Brno | - | FK Baumit Jablonec | 1:0 | |
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| 24. Jornada | 18.04.2009 | FK Baumit Jablonec | - | Slovan Liberec | 0:1 | ||||
| 25. Jornada | 26.04.2009 | FK Teplice | - | FK Baumit Jablonec | 3:0 | |
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| 27. Jornada | 10.05.2009 | Bohemians Praha | - | FK Baumit Jablonec | 4:3 |
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