| 1. Jornada | 22.09.2024 | PAOK Saloniki II | - | AEP Iraklis FC | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 28.09.2024 | PAS Giannina | - | AEP Iraklis FC | 2:1 | ||||
| 3. Jornada | 05.10.2024 | AEP Iraklis FC | - | AO Kavala | 1:1 | ||||
| 4. Jornada | 12.10.2024 | AE Lárissa | - | AEP Iraklis FC | 3:0 |  |
|||
| 5. Jornada | 20.10.2024 | AEP Iraklis FC | - | Ethnikos Neou Keramidiou | 1:0 | ||||
| 6. Jornada | 25.10.2024 | AEP Iraklis FC | - | Diagoras FC | 1:0 | ||||
| 8. Jornada | 08.11.2024 | AEP Iraklis FC | - | Makedonikos FC | 3:0 | ||||
| 9. Jornada | 18.11.2024 | Kampaniakos FC | - | AEP Iraklis FC | 3:3 | |
|||
| 10. Jornada | 24.11.2024 | AEP Iraklis FC | - | PAOK Saloniki II | 2:0 | |
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| 11. Jornada | 30.11.2024 | AEP Iraklis FC | - | PAS Giannina | 3:1 | ||||
| 13. Jornada | 14.12.2024 | AEP Iraklis FC | - | AE Lárissa | 1:2 | |
|||
| 15. Jornada | 12.01.2025 | Diagoras FC | - | AEP Iraklis FC | 0:4 | ||||
| 16. Jornada | 20.01.2025 | AEP Iraklis FC | - | Niki Volou FC | 2:1 | ||||
| 17. Jornada | 25.01.2025 | Makedonikos FC | - | AEP Iraklis FC | 0:2 | ||||
| 18. Jornada | 01.02.2025 | AEP Iraklis FC | - | Kampaniakos FC | 5:0 |
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