| 1. Jornada | 24.02.2024 | Fujieda MyFC | - | V-Varen Nagasaki | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 02.03.2024 | V-Varen Nagasaki | - | Vegalta Sendai | 1:2 | ||||
| 13. Jornada | 03.05.2024 | V-Varen Nagasaki | - | Blaublitz Akita | 2:2 | ||||
| 16. Jornada | 18.05.2024 | Kagoshima United | - | V-Varen Nagasaki | 0:3 | ||||
| 20. Jornada | 16.06.2024 | Vegalta Sendai | - | V-Varen Nagasaki | 2:2 | ||||
| 19. Jornada | 26.06.2024 | V-Varen Nagasaki | - | Iwaki FC | 3:1 | ||||
| 22. Jornada | 29.06.2024 | Tokushima Vortis | - | V-Varen Nagasaki | 2:2 | ||||
| 23. Jornada | 06.07.2024 | V-Varen Nagasaki | - | Roasso Kumamoto | 2:0 | ||||
| 24. Jornada | 14.07.2024 | Ventforet Kofu | - | V-Varen Nagasaki | 2:2 | ||||
| 27. Jornada | 17.08.2024 | Montedio Yamagata | - | V-Varen Nagasaki | 4:2 | ||||
| 29. Jornada | 31.08.2024 | V-Varen Nagasaki | - | Tochigi SC | 1:1 | ||||
| 34. Jornada | 06.10.2024 | V-Varen Nagasaki | - | Oita Trinita | 4:1 | ||||
| 35. Jornada | 20.10.2024 | Blaublitz Akita | - | V-Varen Nagasaki | 1:2 | ||||
| 36. Jornada | 27.10.2024 | V-Varen Nagasaki | - | Kagoshima United | 4:1 |  |
|||
| 37. Jornada | 03.11.2024 | JEF United Chiba | - | V-Varen Nagasaki | 1:2 | ||||
| 38. Jornada | 10.11.2024 | V-Varen Nagasaki | - | Ehime FC | 5:2 |
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