| 1. Jornada | 03.07.2016 | Jaguares de Córdoba | - | Fortaleza FC | 1:0 |  |
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| 2. Jornada | 09.07.2016 | Fortaleza FC | - | Águilas Doradas | 2:1 | ||||
| 3. Jornada | 14.07.2016 | Deportes Tolima | - | Fortaleza FC | 0:0 | ||||
| 4. Jornada | 17.07.2016 | Fortaleza FC | - | Deportivo Cali | 0:2 | ||||
| 5. Jornada | 24.07.2016 | Fortaleza FC | - | Atlético Nacional | 0:1 | ||||
| 6. Jornada | 02.08.2016 | Once Caldas | - | Fortaleza FC | 3:0 | |
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| 7. Jornada | 06.08.2016 | Fortaleza FC | - | Boyacá Chicó | 2:1 | ||||
| 8. Jornada | 14.08.2016 | Millonarios | - | Fortaleza FC | 3:2 | ||||
| 9. Jornada | 21.08.2016 | Fortaleza FC | - | Atlético Bucaramanga | 1:2 | ||||
| 11. Jornada | 11.09.2016 | Atlético Junior | - | Fortaleza FC | 1:2 | ||||
| 13. Jornada | 18.09.2016 | Cortuluá | - | Fortaleza FC | 2:2 | ||||
| 14. Jornada | 24.09.2016 | Fortaleza FC | - | La Equidad | 1:1 |  |
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| 16. Jornada | 15.10.2016 | Fortaleza FC | - | Independiente Medellín | 2:1 | ||||
| 17. Jornada | 22.10.2016 | Patriotas FC | - | Fortaleza FC | 1:0 | ||||
| 18. Jornada | 30.10.2016 | Fortaleza FC | - | Santa Fe | 1:1 |
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