| 17. Jornada | 02.12.2012 | SC Paderborn 07 | - | MSV Duisburg | 0:2 |  |
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| 18. Jornada | 07.12.2012 | VfR Aalen | - | MSV Duisburg | 0:1 | ||||
| 19. Jornada | 16.12.2012 | MSV Duisburg | - | Jahn Regensburg | 4:2 | ||||
| 20. Jornada | 01.02.2013 | Dynamo Dresden | - | MSV Duisburg | 0:0 | ||||
| 21. Jornada | 09.02.2013 | MSV Duisburg | - | TSV 1860 München | 1:3 | ||||
| 22. Jornada | 17.02.2013 | MSV Duisburg | - | 1. FC Kaiserslautern | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 22.02.2013 | VfL Bochum | - | MSV Duisburg | 2:2 | |
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| 24. Jornada | 04.03.2013 | MSV Duisburg | - | Eintracht Braunschweig | 1:0 | ||||
| 25. Jornada | 10.03.2013 | Hertha | - | MSV Duisburg | 4:2 | |
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| 26. Jornada | 15.03.2013 | MSV Duisburg | - | Energie Cottbus | 2:1 | ||||
| 27. Jornada | 30.03.2013 | Ingolstadt | - | MSV Duisburg | 0:1 | |
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| 28. Jornada | 07.04.2013 | MSV Duisburg | - | SV Sandhausen | 2:1 | |
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| 29. Jornada | 13.04.2013 | FSV Frankfurt | - | MSV Duisburg | 1:1 | ||||
| 30. Jornada | 22.04.2013 | MSV Duisburg | - | Colonia | 1:1 | ||||
| 31. Jornada | 27.04.2013 | Erzgebirge Aue | - | MSV Duisburg | 0:0 | ||||
| 32. Jornada | 05.05.2013 | MSV Duisburg | - | FC St. Pauli | 0:0 | |
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| 34. Jornada | 19.05.2013 | MSV Duisburg | - | SC Paderborn 07 | 3:2 | |
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