| 11. Jornada | 15.10.2016 | FC Winterthur | - | FC Chiasso | 1:1 | ||||
| 13. Jornada | 30.10.2016 | FC Aarau | - | FC Winterthur | 1:1 | ||||
| 17. Jornada | 03.12.2016 | Servette FC | - | FC Winterthur | 1:1 | ||||
| 20. Jornada | 11.02.2017 | FC Winterthur | - | Servette FC | 1:4 | ||||
| 21. Jornada | 20.02.2017 | FC Winterthur | - | FC Wohlen | 2:1 | ||||
| 22. Jornada | 25.02.2017 | FC Schaffhausen | - | FC Winterthur | 2:1 | ||||
| 25. Jornada | 18.03.2017 | FC Zürich | - | FC Winterthur | 2:2 | ||||
| 27. Jornada | 09.04.2017 | FC Aarau | - | FC Winterthur | 2:3 | ||||
| 28. Jornada | 15.04.2017 | FC Winterthur | - | FC Le Mont | 4:1 | ||||
| 29. Jornada | 22.04.2017 | Servette FC | - | FC Winterthur | 2:3 | ||||
| 30. Jornada | 29.04.2017 | FC Winterthur | - | FC Aarau | 3:2 | ||||
| 31. Jornada | 07.05.2017 | FC Wohlen | - | FC Winterthur | 2:1 |  |
|||
| 33. Jornada | 17.05.2017 | FC Wil 1900 | - | FC Winterthur | 0:1 | |
|||
| 35. Jornada | 27.05.2017 | Neuchâtel Xamax FCS | - | FC Winterthur | 4:1 | |
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