| 16. Jornada | 21.02.2016 | VfL Halle 96 | - | FC Eisenach | 6:1 | ||||
| 17. Jornada | 28.02.2016 | FC Eisenach | - | Energie Cottbus II | 0:2 | ||||
| 18. Jornada | 06.03.2016 | SSV Markranstädt | - | FC Eisenach | 6:0 | ||||
| 20. Jornada | 20.03.2016 | BSG Wismut Gera | - | FC Eisenach | 4:0 | ||||
| 21. Jornada | 03.04.2016 | FC Eisenach | - | FC Einheit Rudolstadt | 0:2 | ||||
| 22. Jornada | 10.04.2016 | FC Eisenach | - | FSV Barleben | 0:5 | ||||
| 23. Jornada | 17.04.2016 | SV SCHOTT Jena | - | FC Eisenach | 3:0 | ||||
| 25. Jornada | 01.05.2016 | Bischofswerdaer FV | - | FC Eisenach | 4:1 | ||||
| 26. Jornada | 08.05.2016 | FC Eisenach | - | 1. FC Lok Leipzig | 0:2 | ||||
| 27. Jornada | 15.05.2016 | Rot-Weiß Erfurt II | - | FC Eisenach | 2:0 | ||||
| 28. Jornada | 22.05.2016 | FC Eisenach | - | VFC Plauen | 1:3 |  |
|||
| 29. Jornada | 05.06.2016 | Union Sandersdorf | - | FC Eisenach | 3:1 | ||||
| 30. Jornada | 12.06.2016 | FC Eisenach | - | FC Carl Zeiss Jena II | 0:7 |
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