| 6. Jornada | 10.09.2016 | Sparta Praga | - | FK Mladá Boleslav | 2:2 |  |
|||
| 7. Jornada | 17.09.2016 | FK Mladá Boleslav | - | 1. FC Slovácko | 3:0 | ||||
| 14. Jornada | 19.11.2016 | FK Mladá Boleslav | - | Viktoria Plzeň | 0:0 | |
|||
| 15. Jornada | 26.11.2016 | Slavia Praga | - | FK Mladá Boleslav | 2:1 | ||||
| 16. Jornada | 04.12.2016 | FK Mladá Boleslav | - | 1. FK Příbram | 2:2 |  |
|||
| 20. Jornada | 12.03.2017 | FK Mladá Boleslav | - | Sparta Praga | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 18.03.2017 | 1. FC Slovácko | - | FK Mladá Boleslav | 2:1 |
República Checa