| 17. Jornada | 30.01.2000 | Skoda Xanthi | - | Ionikos Nikea | 2:1 |  |
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| 20. Jornada | 21.02.2000 | Skoda Xanthi | - | PS Kalamata | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 27.02.2000 | Panachaiki GE | - | Skoda Xanthi | 1:1 | ||||
| 22. Jornada | 05.03.2000 | Skoda Xanthi | - | AO Proodeftiki | 2:1 | |
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| 23. Jornada | 12.03.2000 | Panionios GSS | - | Skoda Xanthi | 4:0 | ||||
| 25. Jornada | 26.03.2000 | AO Kavala | - | Skoda Xanthi | 1:0 | |
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| 26. Jornada | 02.04.2000 | Skoda Xanthi | - | AO Trikala | 3:0 | |
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| 33. Jornada | 21.05.2000 | Skoda Xanthi | - | Olympiacos | 0:1 |
Grecia