Segunda etapa
09.08.2016 17:00 TJ Nový Jičín - MFK Karviná 1:2
10.08.2016 17:00 FK Šumperk - SFC Opava 1:4 (1:1)
17:00 MFK Chrudim - MFK Vítkovice 1:0 (0:0, 0:0) pró.
17:00 SK Líšeň - 1. SK Prostějov 1:3 (1:1)
17:00 Slavoj Polná - Sigma Olomouc 1:10
17:00 FC Hlučín - MFK Frýdek-Místek, a.s. 2:1 (1:1, 1:1) pró.
17:00 Spartak Hulín - 1. SC Znojmo 2:1
17:00 SK Uničov - 1. FC Slovácko 1:3
17:00 FC Slavičín - Zbrojovka Brno 1:3 (0:2)
17:00 SK Klatovy 1898 - Vysočina Jihlava 1:9
17:00 TJ Jiskra Domažlice - FK Jablonec 1:4
17:00 FK TJ Štěchovice - Bohemians Praha 1905 2:3 (1:1)
17:00 FK Loko Vltavín - FK MAS Táborsko 1:2 (1:1)
17:00 FC Písek - FK Varnsdorf 3:0
17:00 Sokol Živanice - FK Pardubice 0:1
17:00 FK Admira Praha - FC Hradec Králové 1:4
17:00 SK Převýšov - FK Dukla Praha 0:3
17:00 FK Tachov - Viktoria Žižkov 2:1 pn.
17:00 Benátky nad Jizerou - FC Sellier & Bellot Vlašim 2:5 pró.
17:00 SK Český Brod - Dynamo České Budějovice 3:4
17:00 FK Králův Dvůr - FK Teplice 1:0 (1:0)
16.08.2016 17:00 FK Litoměřice - 1. FK Příbram 3:1 (3:0)
17.08.2016 17:00 Velké Mezirící - FK Fotbal Třinec 2:1
23.08.2016 16:30 MSK Breclav - Baník Ostrava 0:6 (0:2)
17:00 HFK Třebíč - FC Fastav Zlín 0:4 (0:2)
17:00 SK Benešov - FK Ústí nad Labem 2:4 (2:2)
24.08.2016 17:00 SK Zápy - FK Baník Sokolov 2:1 (1:0)
Tercera ronda
14.09.2016 16:30 SK Zápy - FK Mladá Boleslav 1:2 (1:1)
20.09.2016 16:00 Spartak Hulín - Bohemians Praha 1905 0:2 (0:1)
16:00 FC Sellier & Bellot Vlašim - FC Hradec Králové 0:1 (0:1)
16:30 FK Pardubice - Vysočina Jihlava 1:3 (1:3)
17:00 Sigma Olomouc - FK MAS Táborsko 1:2 (0:2)
21.09.2016 16:00 FK Litoměřice - Baník Ostrava 2:1 (0:0)
16:30 FC Hlučín - Viktoria Plzeň 0:7 (0:2)
16:30 Velké Mezirící - FK Dukla Praha 1:2 (0:0)
17:00 FK Ústí nad Labem - Zbrojovka Brno 1:4 (1:1)
27.09.2016 15:30 MFK Karviná - 1. SK Prostějov 2:0 (0:0, 0:0) pró.
28.09.2016 16:00 MFK Chrudim - Slavia Praga 1:3 (0:1)
05.10.2016 16:00 FK Tachov - FC Fastav Zlín 0:4 (0:2)
11.10.2016 16:00 FK Králův Dvůr - FK Jablonec 5:3 (1:1, 1:1, 1:1) pn.
18:00 1. FC Slovácko - SFC Opava 3:4 (1:0, 2:2) pró.
12.10.2016 16:00 FC Písek - Slovan Liberec 1:5 (1:4)
16:00 Dynamo České Budějovice - Sparta Praga 1:2 (0:0)
Octavos de final
26.10.2016 15:30 FK Mladá Boleslav - FC Hradec Králové 4:2 (2:1)
16:30 FC Fastav Zlín - Sparta Praga 3:1 (0:1, 1:1) pró.
16:30 SFC Opava - Viktoria Plzeň 4:2 (1:1)
17:00 Zbrojovka Brno - Vysočina Jihlava 2:1 (1:0)
18:00 Bohemians Praha 1905 - FK Králův Dvůr 3:1 (2:0)
18:30 Slavia Praga - FK Litoměřice 7:0 (4:0)
30.11.2016 16:00 MFK Karviná - FK Dukla Praha 4:2 (0:0, 1:1, 2:2) pn.
01.03.2017 13:00 FK MAS Táborsko - Slovan Liberec 1:3 (1:2)
Cuartos de final
26.03.2017 12:15 SFC Opava - Zbrojovka Brno 2:1 (0:1)
04.04.2017 20:15 Bohemians Praha 1905 - FK Mladá Boleslav 3:4 (0:0, 1:1, 1:1) pn.
05.04.2017 20:15 Slovan Liberec - FC Fastav Zlín 2:4 (1:0, 2:2) pró.
12.04.2017 18:45 Slavia Praga - MFK Karviná 5:2 (2:1)
Semifinales
25.04.2017 18:30 Slavia Praga - FC Fastav Zlín 0:1 (0:1)
26.04.2017 17:00 FK Mladá Boleslav - SFC Opava 0:2 (0:2)
Final
17.05.2017 17:30 FC Fastav Zlín - SFC Opava 1:0 (1:0)
Pohár FAČR
Pohár FAČR